Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sall3Q62255 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 192.8 ms