Protein–RNA interactions for Protein: Q62176

Rbm38, RNA-binding protein 38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm38Q62176 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rbm38Q62176 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rbm38Q62176 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rbm38Q62176 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rbm38Q62176 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Rbm38Q62176 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rbm38Q62176 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rbm38Q62176 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rbm38Q62176 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Rbm38Q62176 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rbm38Q62176 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rbm38Q62176 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rbm38Q62176 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rbm38Q62176 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rbm38Q62176 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rbm38Q62176 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rbm38Q62176 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rbm38Q62176 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rbm38Q62176 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rbm38Q62176 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rbm38Q62176 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rbm38Q62176 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rbm38Q62176 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rbm38Q62176 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rbm38Q62176 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rbm38Q62176 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rbm38Q62176 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rbm38Q62176 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rbm38Q62176 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rbm38Q62176 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rbm38Q62176 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rbm38Q62176 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rbm38Q62176 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rbm38Q62176 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rbm38Q62176 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rbm38Q62176 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Rbm38Q62176 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rbm38Q62176 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rbm38Q62176 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rbm38Q62176 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rbm38Q62176 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rbm38Q62176 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rbm38Q62176 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rbm38Q62176 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rbm38Q62176 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rbm38Q62176 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rbm38Q62176 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rbm38Q62176 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rbm38Q62176 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rbm38Q62176 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rbm38Q62176 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rbm38Q62176 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rbm38Q62176 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Rbm38Q62176 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rbm38Q62176 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rbm38Q62176 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rbm38Q62176 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rbm38Q62176 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Rbm38Q62176 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
Rbm38Q62176 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rbm38Q62176 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
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