Protein–RNA interactions for Protein: Q62066

Phox2a, Paired mesoderm homeobox protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2aQ62066 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Phox2aQ62066 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Phox2aQ62066 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Phox2aQ62066 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Phox2aQ62066 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Phox2aQ62066 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Phox2aQ62066 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Phox2aQ62066 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Phox2aQ62066 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Phox2aQ62066 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Phox2aQ62066 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Phox2aQ62066 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Phox2aQ62066 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Phox2aQ62066 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Phox2aQ62066 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Phox2aQ62066 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Phox2aQ62066 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Phox2aQ62066 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Phox2aQ62066 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Phox2aQ62066 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Phox2aQ62066 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Phox2aQ62066 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Phox2aQ62066 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Phox2aQ62066 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Phox2aQ62066 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Phox2aQ62066 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Phox2aQ62066 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Phox2aQ62066 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Phox2aQ62066 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Phox2aQ62066 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Phox2aQ62066 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Phox2aQ62066 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Phox2aQ62066 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Phox2aQ62066 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Phox2aQ62066 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Phox2aQ62066 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Phox2aQ62066 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Phox2aQ62066 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Phox2aQ62066 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Phox2aQ62066 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Phox2aQ62066 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Phox2aQ62066 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Phox2aQ62066 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Phox2aQ62066 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Phox2aQ62066 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Phox2aQ62066 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Phox2aQ62066 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Phox2aQ62066 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Phox2aQ62066 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Phox2aQ62066 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Phox2aQ62066 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Phox2aQ62066 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Phox2aQ62066 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Phox2aQ62066 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Phox2aQ62066 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Phox2aQ62066 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Phox2aQ62066 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Phox2aQ62066 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Phox2aQ62066 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Phox2aQ62066 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Phox2aQ62066 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Phox2aQ62066 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Phox2aQ62066 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Phox2aQ62066 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Phox2aQ62066 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Phox2aQ62066 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Phox2aQ62066 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Phox2aQ62066 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Phox2aQ62066 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Phox2aQ62066 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Phox2aQ62066 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Phox2aQ62066 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Phox2aQ62066 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Phox2aQ62066 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Phox2aQ62066 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Phox2aQ62066 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Phox2aQ62066 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Phox2aQ62066 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Phox2aQ62066 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Phox2aQ62066 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Phox2aQ62066 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Phox2aQ62066 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Phox2aQ62066 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Phox2aQ62066 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Phox2aQ62066 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Phox2aQ62066 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Phox2aQ62066 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Phox2aQ62066 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Phox2aQ62066 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Phox2aQ62066 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Phox2aQ62066 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Phox2aQ62066 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Phox2aQ62066 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Phox2aQ62066 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Phox2aQ62066 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Phox2aQ62066 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Phox2aQ62066 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Phox2aQ62066 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Phox2aQ62066 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Phox2aQ62066 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms