Protein–RNA interactions for Protein: Q61716

Ifna11, Interferon alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna11Q61716 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ifna11Q61716 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ifna11Q61716 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ifna11Q61716 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ifna11Q61716 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ifna11Q61716 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ifna11Q61716 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ifna11Q61716 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ifna11Q61716 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ifna11Q61716 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ifna11Q61716 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ifna11Q61716 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ifna11Q61716 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ifna11Q61716 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ifna11Q61716 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ifna11Q61716 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna11Q61716 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna11Q61716 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna11Q61716 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna11Q61716 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna11Q61716 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna11Q61716 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna11Q61716 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna11Q61716 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna11Q61716 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna11Q61716 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna11Q61716 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna11Q61716 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna11Q61716 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna11Q61716 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna11Q61716 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna11Q61716 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna11Q61716 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna11Q61716 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna11Q61716 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna11Q61716 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna11Q61716 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna11Q61716 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna11Q61716 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna11Q61716 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna11Q61716 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna11Q61716 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna11Q61716 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna11Q61716 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna11Q61716 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna11Q61716 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna11Q61716 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna11Q61716 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna11Q61716 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna11Q61716 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna11Q61716 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna11Q61716 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna11Q61716 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna11Q61716 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna11Q61716 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna11Q61716 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna11Q61716 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna11Q61716 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna11Q61716 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna11Q61716 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna11Q61716 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna11Q61716 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna11Q61716 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna11Q61716 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna11Q61716 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna11Q61716 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna11Q61716 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna11Q61716 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna11Q61716 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna11Q61716 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna11Q61716 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ifna11Q61716 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ifna11Q61716 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms