Protein–RNA interactions for Protein: Q61474

Msi1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi1Q61474 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Msi1Q61474 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Msi1Q61474 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Msi1Q61474 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Msi1Q61474 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Msi1Q61474 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Msi1Q61474 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Msi1Q61474 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Msi1Q61474 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Msi1Q61474 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Msi1Q61474 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Msi1Q61474 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Msi1Q61474 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Msi1Q61474 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Msi1Q61474 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Msi1Q61474 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Msi1Q61474 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Msi1Q61474 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Msi1Q61474 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Msi1Q61474 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Msi1Q61474 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Msi1Q61474 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Msi1Q61474 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Msi1Q61474 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Msi1Q61474 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Msi1Q61474 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Msi1Q61474 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Msi1Q61474 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Msi1Q61474 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Msi1Q61474 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Msi1Q61474 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Msi1Q61474 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Msi1Q61474 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms