Protein–RNA interactions for Protein: Q61345

Foxd1, Forkhead box protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd1Q61345 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Gm19640-201ENSMUST00000214849 464 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Foxd1Q61345 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Foxd1Q61345 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Foxd1Q61345 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Foxd1Q61345 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Foxd1Q61345 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Foxd1Q61345 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Foxd1Q61345 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Foxd1Q61345 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Foxd1Q61345 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Foxd1Q61345 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Foxd1Q61345 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Foxd1Q61345 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Foxd1Q61345 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Foxd1Q61345 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Foxd1Q61345 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Foxd1Q61345 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Foxd1Q61345 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Foxd1Q61345 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Foxd1Q61345 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Foxd1Q61345 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Foxd1Q61345 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Foxd1Q61345 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Foxd1Q61345 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Foxd1Q61345 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Foxd1Q61345 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Foxd1Q61345 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Foxd1Q61345 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms