Protein–RNA interactions for Protein: Q60974

Ncor1, Nuclear receptor corepressor 1, mousemouse

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Length 2,453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncor1Q60974 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ncor1Q60974 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ncor1Q60974 Defa3-201ENSMUST00000098893 410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ncor1Q60974 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Ncor1Q60974 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ncor1Q60974 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ncor1Q60974 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ncor1Q60974 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ncor1Q60974 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ncor1Q60974 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ncor1Q60974 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ncor1Q60974 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ncor1Q60974 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ncor1Q60974 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ncor1Q60974 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ncor1Q60974 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ncor1Q60974 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ncor1Q60974 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Ncor1Q60974 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ncor1Q60974 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ncor1Q60974 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ncor1Q60974 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ncor1Q60974 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ncor1Q60974 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ncor1Q60974 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ncor1Q60974 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Ncor1Q60974 Gm28901-201ENSMUST00000188810 474 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ncor1Q60974 Gm18256-201ENSMUST00000209087 907 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ncor1Q60974 Isca2-206ENSMUST00000222449 374 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ncor1Q60974 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ncor1Q60974 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ncor1Q60974 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Ncor1Q60974 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Ncor1Q60974 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ncor1Q60974 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Ncor1Q60974 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Ncor1Q60974 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ncor1Q60974 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Ncor1Q60974 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ncor1Q60974 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ncor1Q60974 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ncor1Q60974 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ncor1Q60974 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ncor1Q60974 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ncor1Q60974 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ncor1Q60974 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ncor1Q60974 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ncor1Q60974 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ncor1Q60974 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ncor1Q60974 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ncor1Q60974 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ncor1Q60974 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ncor1Q60974 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ncor1Q60974 Tnnt3-213ENSMUST00000105952 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ncor1Q60974 Tnnt3-215ENSMUST00000105954 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ncor1Q60974 Tnnt3-216ENSMUST00000105955 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ncor1Q60974 Tnnt3-218ENSMUST00000105958 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ncor1Q60974 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ncor1Q60974 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ncor1Q60974 Tnnt3-225ENSMUST00000179658 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ncor1Q60974 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ncor1Q60974 Gm45542-201ENSMUST00000210456 438 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ncor1Q60974 Gm7192-201ENSMUST00000210793 1137 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms