Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

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Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Traf3Q60803 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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