Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Gm44845-201ENSMUST00000208773 335 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 2310061N02Rik-201ENSMUST00000050882 794 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Hormad1-203ENSMUST00000107154 1444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Gm3650-201ENSMUST00000180600 747 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Gm21739-202ENSMUST00000188917 933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Krtap9-1-201ENSMUST00000093936 1044 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Gm15445-201ENSMUST00000146700 603 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Prl3c1-203ENSMUST00000178072 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Gm43222-201ENSMUST00000199013 603 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Gm43974-201ENSMUST00000205080 684 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 4921513I08Rik-201ENSMUST00000206993 866 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Mkrn3Q60764 AC154252.1-201ENSMUST00000226041 473 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms