Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim38Q5SZ99 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms