Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Psme4Q5SSW2 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms