Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPX3

Rnf215, RING finger protein 215, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf215Q5SPX3 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf215Q5SPX3 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf215Q5SPX3 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf215Q5SPX3 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf215Q5SPX3 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf215Q5SPX3 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf215Q5SPX3 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf215Q5SPX3 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf215Q5SPX3 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf215Q5SPX3 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf215Q5SPX3 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf215Q5SPX3 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf215Q5SPX3 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf215Q5SPX3 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf215Q5SPX3 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf215Q5SPX3 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rnf215Q5SPX3 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf215Q5SPX3 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf215Q5SPX3 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf215Q5SPX3 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf215Q5SPX3 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf215Q5SPX3 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf215Q5SPX3 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf215Q5SPX3 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf215Q5SPX3 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf215Q5SPX3 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf215Q5SPX3 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf215Q5SPX3 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf215Q5SPX3 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf215Q5SPX3 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf215Q5SPX3 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf215Q5SPX3 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf215Q5SPX3 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf215Q5SPX3 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf215Q5SPX3 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf215Q5SPX3 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf215Q5SPX3 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf215Q5SPX3 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf215Q5SPX3 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rnf215Q5SPX3 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf215Q5SPX3 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf215Q5SPX3 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf215Q5SPX3 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf215Q5SPX3 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf215Q5SPX3 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf215Q5SPX3 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf215Q5SPX3 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf215Q5SPX3 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf215Q5SPX3 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf215Q5SPX3 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf215Q5SPX3 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf215Q5SPX3 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf215Q5SPX3 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf215Q5SPX3 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf215Q5SPX3 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf215Q5SPX3 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf215Q5SPX3 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf215Q5SPX3 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf215Q5SPX3 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf215Q5SPX3 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf215Q5SPX3 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf215Q5SPX3 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf215Q5SPX3 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf215Q5SPX3 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf215Q5SPX3 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf215Q5SPX3 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf215Q5SPX3 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf215Q5SPX3 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf215Q5SPX3 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf215Q5SPX3 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf215Q5SPX3 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf215Q5SPX3 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf215Q5SPX3 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf215Q5SPX3 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf215Q5SPX3 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf215Q5SPX3 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf215Q5SPX3 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf215Q5SPX3 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf215Q5SPX3 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf215Q5SPX3 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf215Q5SPX3 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf215Q5SPX3 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf215Q5SPX3 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf215Q5SPX3 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf215Q5SPX3 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf215Q5SPX3 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf215Q5SPX3 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf215Q5SPX3 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf215Q5SPX3 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf215Q5SPX3 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf215Q5SPX3 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf215Q5SPX3 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf215Q5SPX3 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf215Q5SPX3 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf215Q5SPX3 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf215Q5SPX3 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf215Q5SPX3 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf215Q5SPX3 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf215Q5SPX3 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf215Q5SPX3 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms