Protein–RNA interactions for Protein: Q504M2

Pdp2, MCG53395, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdp2Q504M2 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pdp2Q504M2 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pdp2Q504M2 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pdp2Q504M2 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pdp2Q504M2 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pdp2Q504M2 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pdp2Q504M2 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms