Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Tex30-201ENSMUST00000027215 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shank3Q4ACU6 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shank3Q4ACU6 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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