Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q7

Pacs2, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, mousemouse

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs2Q3V3Q7 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Rpa3-201ENSMUST00000012627 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Gm20854-201ENSMUST00000178889 1002 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 1700003C15Rik-202ENSMUST00000188236 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 AC129323.1-201ENSMUST00000216733 470 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Pacs2Q3V3Q7 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Pacs2Q3V3Q7 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Pacs2Q3V3Q7 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Pacs2Q3V3Q7 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms