Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Q1

Dnah12, Dynein heavy chain 12, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 3,086 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnah12Q3V0Q1 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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Dnah12Q3V0Q1 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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Dnah12Q3V0Q1 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Dnah12Q3V0Q1 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms