Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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Lrrc43Q3V0L5 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc43Q3V0L5 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc43Q3V0L5 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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Lrrc43Q3V0L5 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc43Q3V0L5 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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Lrrc43Q3V0L5 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc43Q3V0L5 Ifna13-201ENSMUST00000105149 819 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc43Q3V0L5 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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Lrrc43Q3V0L5 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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Lrrc43Q3V0L5 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc43Q3V0L5 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc43Q3V0L5 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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