Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Ttc9Q3V038 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Ttc9Q3V038 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Ttc9Q3V038 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Ttc9Q3V038 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Ttc9Q3V038 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Ttc9Q3V038 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ttc9Q3V038 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms