Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc27Q3V036 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc27Q3V036 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc27Q3V036 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc27Q3V036 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc27Q3V036 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc27Q3V036 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc27Q3V036 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc27Q3V036 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc27Q3V036 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc27Q3V036 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc27Q3V036 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc27Q3V036 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc27Q3V036 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc27Q3V036 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc27Q3V036 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc27Q3V036 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc27Q3V036 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc27Q3V036 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc27Q3V036 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc27Q3V036 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc27Q3V036 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc27Q3V036 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc27Q3V036 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc27Q3V036 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc27Q3V036 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc27Q3V036 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc27Q3V036 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc27Q3V036 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc27Q3V036 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc27Q3V036 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc27Q3V036 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc27Q3V036 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc27Q3V036 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc27Q3V036 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc27Q3V036 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc27Q3V036 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc27Q3V036 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc27Q3V036 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc27Q3V036 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc27Q3V036 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc27Q3V036 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc27Q3V036 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc27Q3V036 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc27Q3V036 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc27Q3V036 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc27Q3V036 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc27Q3V036 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc27Q3V036 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc27Q3V036 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc27Q3V036 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc27Q3V036 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc27Q3V036 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc27Q3V036 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc27Q3V036 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc27Q3V036 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc27Q3V036 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc27Q3V036 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc27Q3V036 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc27Q3V036 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc27Q3V036 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc27Q3V036 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc27Q3V036 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc27Q3V036 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc27Q3V036 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc27Q3V036 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc27Q3V036 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc27Q3V036 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc27Q3V036 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc27Q3V036 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc27Q3V036 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc27Q3V036 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc27Q3V036 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc27Q3V036 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc27Q3V036 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc27Q3V036 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc27Q3V036 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc27Q3V036 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc27Q3V036 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc27Q3V036 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc27Q3V036 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc27Q3V036 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc27Q3V036 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc27Q3V036 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc27Q3V036 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc27Q3V036 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc27Q3V036 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc27Q3V036 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc27Q3V036 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc27Q3V036 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc27Q3V036 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc27Q3V036 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc27Q3V036 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc27Q3V036 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc27Q3V036 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc27Q3V036 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc27Q3V036 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc27Q3V036 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc27Q3V036 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc27Q3V036 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.2 ms