Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR9

Sbspon, Somatomedin-B and thrombospondin type-1 domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsponQ3UPR9 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms