Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms