Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp19Q3UJD6 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms