Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc34Q3UI66 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc34Q3UI66 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc34Q3UI66 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc34Q3UI66 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc34Q3UI66 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc34Q3UI66 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc34Q3UI66 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc34Q3UI66 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc34Q3UI66 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc34Q3UI66 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc34Q3UI66 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc34Q3UI66 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc34Q3UI66 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc34Q3UI66 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc34Q3UI66 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc34Q3UI66 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc34Q3UI66 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc34Q3UI66 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc34Q3UI66 Gm28923-201ENSMUST00000187755 322 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc34Q3UI66 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc34Q3UI66 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc34Q3UI66 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc34Q3UI66 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc34Q3UI66 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc34Q3UI66 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc34Q3UI66 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc34Q3UI66 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Il4-204ENSMUST00000150568 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc34Q3UI66 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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