Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nkx6-3Q3UHX8 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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