Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGY8

Arfgef3, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef3Q3UGY8 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Arfgef3Q3UGY8 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Arfgef3Q3UGY8 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Arfgef3Q3UGY8 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Arfgef3Q3UGY8 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Arfgef3Q3UGY8 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Arfgef3Q3UGY8 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Arfgef3Q3UGY8 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Arfgef3Q3UGY8 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Arfgef3Q3UGY8 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Arfgef3Q3UGY8 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Arfgef3Q3UGY8 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Arfgef3Q3UGY8 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Arfgef3Q3UGY8 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Arfgef3Q3UGY8 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Arfgef3Q3UGY8 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Arfgef3Q3UGY8 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Arfgef3Q3UGY8 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Arfgef3Q3UGY8 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Arfgef3Q3UGY8 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Arfgef3Q3UGY8 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Arfgef3Q3UGY8 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Arfgef3Q3UGY8 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Arfgef3Q3UGY8 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Arfgef3Q3UGY8 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Arfgef3Q3UGY8 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Arfgef3Q3UGY8 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Arfgef3Q3UGY8 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Arfgef3Q3UGY8 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Arfgef3Q3UGY8 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Arfgef3Q3UGY8 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Arfgef3Q3UGY8 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Arfgef3Q3UGY8 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Arfgef3Q3UGY8 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Arfgef3Q3UGY8 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Arfgef3Q3UGY8 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Arfgef3Q3UGY8 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Arfgef3Q3UGY8 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Arfgef3Q3UGY8 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Arfgef3Q3UGY8 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Arfgef3Q3UGY8 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Arfgef3Q3UGY8 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Arfgef3Q3UGY8 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Arfgef3Q3UGY8 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Arfgef3Q3UGY8 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Arfgef3Q3UGY8 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Arfgef3Q3UGY8 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Arfgef3Q3UGY8 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Arfgef3Q3UGY8 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Arfgef3Q3UGY8 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Arfgef3Q3UGY8 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Arfgef3Q3UGY8 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Arfgef3Q3UGY8 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Arfgef3Q3UGY8 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Arfgef3Q3UGY8 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Arfgef3Q3UGY8 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Arfgef3Q3UGY8 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Arfgef3Q3UGY8 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
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Arfgef3Q3UGY8 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Arfgef3Q3UGY8 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Arfgef3Q3UGY8 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Arfgef3Q3UGY8 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Arfgef3Q3UGY8 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Arfgef3Q3UGY8 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Arfgef3Q3UGY8 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Arfgef3Q3UGY8 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Arfgef3Q3UGY8 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Arfgef3Q3UGY8 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Arfgef3Q3UGY8 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Arfgef3Q3UGY8 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Arfgef3Q3UGY8 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Arfgef3Q3UGY8 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Arfgef3Q3UGY8 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Arfgef3Q3UGY8 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Arfgef3Q3UGY8 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Arfgef3Q3UGY8 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Arfgef3Q3UGY8 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Arfgef3Q3UGY8 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Arfgef3Q3UGY8 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Arfgef3Q3UGY8 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Arfgef3Q3UGY8 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Arfgef3Q3UGY8 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Arfgef3Q3UGY8 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Arfgef3Q3UGY8 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Arfgef3Q3UGY8 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Arfgef3Q3UGY8 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Arfgef3Q3UGY8 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Arfgef3Q3UGY8 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Arfgef3Q3UGY8 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Arfgef3Q3UGY8 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Arfgef3Q3UGY8 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Arfgef3Q3UGY8 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Arfgef3Q3UGY8 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Arfgef3Q3UGY8 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Arfgef3Q3UGY8 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms