Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q3U6N9 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q3U6N9 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Q3U6N9 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Q3U6N9 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Q3U6N9 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q3U6N9 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
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Q3U6N9 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Q3U6N9 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Q3U6N9 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q3U6N9 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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