Protein–RNA interactions for Protein: Q3U319

Rnf40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, mousemouse

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf40Q3U319 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf40Q3U319 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf40Q3U319 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf40Q3U319 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf40Q3U319 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf40Q3U319 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf40Q3U319 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf40Q3U319 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf40Q3U319 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf40Q3U319 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf40Q3U319 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf40Q3U319 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf40Q3U319 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf40Q3U319 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf40Q3U319 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf40Q3U319 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf40Q3U319 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf40Q3U319 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf40Q3U319 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Rnf40Q3U319 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Rnf40Q3U319 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf40Q3U319 Gm8872-201ENSMUST00000197475 1341 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf40Q3U319 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf40Q3U319 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf40Q3U319 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf40Q3U319 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf40Q3U319 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf40Q3U319 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf40Q3U319 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf40Q3U319 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf40Q3U319 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf40Q3U319 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf40Q3U319 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf40Q3U319 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf40Q3U319 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf40Q3U319 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf40Q3U319 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf40Q3U319 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf40Q3U319 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf40Q3U319 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf40Q3U319 Ifna16-201ENSMUST00000105148 1010 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf40Q3U319 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf40Q3U319 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf40Q3U319 Celrr-201ENSMUST00000181183 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf40Q3U319 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf40Q3U319 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf40Q3U319 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf40Q3U319 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf40Q3U319 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf40Q3U319 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf40Q3U319 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf40Q3U319 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf40Q3U319 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf40Q3U319 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf40Q3U319 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf40Q3U319 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf40Q3U319 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf40Q3U319 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf40Q3U319 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf40Q3U319 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
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Rnf40Q3U319 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Rnf40Q3U319 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Rnf40Q3U319 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf40Q3U319 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf40Q3U319 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf40Q3U319 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf40Q3U319 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf40Q3U319 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf40Q3U319 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf40Q3U319 1700022E09Rik-202ENSMUST00000188342 387 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf40Q3U319 Gm37612-201ENSMUST00000193626 582 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf40Q3U319 Gm44146-201ENSMUST00000203508 816 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf40Q3U319 Olfr967-202ENSMUST00000213358 1210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf40Q3U319 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf40Q3U319 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf40Q3U319 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf40Q3U319 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf40Q3U319 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf40Q3U319 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf40Q3U319 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf40Q3U319 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf40Q3U319 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf40Q3U319 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf40Q3U319 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf40Q3U319 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf40Q3U319 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf40Q3U319 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf40Q3U319 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf40Q3U319 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf40Q3U319 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf40Q3U319 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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