Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms