Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms