Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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