Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctdnep1Q3TP92 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ctdnep1Q3TP92 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctdnep1Q3TP92 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ctdnep1Q3TP92 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctdnep1Q3TP92 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctdnep1Q3TP92 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctdnep1Q3TP92 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ctdnep1Q3TP92 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ctdnep1Q3TP92 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctdnep1Q3TP92 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctdnep1Q3TP92 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ctdnep1Q3TP92 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctdnep1Q3TP92 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctdnep1Q3TP92 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ctdnep1Q3TP92 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctdnep1Q3TP92 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ctdnep1Q3TP92 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctdnep1Q3TP92 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctdnep1Q3TP92 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctdnep1Q3TP92 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctdnep1Q3TP92 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctdnep1Q3TP92 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctdnep1Q3TP92 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctdnep1Q3TP92 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctdnep1Q3TP92 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctdnep1Q3TP92 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ctdnep1Q3TP92 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctdnep1Q3TP92 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ctdnep1Q3TP92 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ctdnep1Q3TP92 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctdnep1Q3TP92 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctdnep1Q3TP92 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ctdnep1Q3TP92 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctdnep1Q3TP92 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctdnep1Q3TP92 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ctdnep1Q3TP92 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ctdnep1Q3TP92 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ctdnep1Q3TP92 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ctdnep1Q3TP92 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ctdnep1Q3TP92 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ctdnep1Q3TP92 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ctdnep1Q3TP92 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctdnep1Q3TP92 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctdnep1Q3TP92 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctdnep1Q3TP92 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ctdnep1Q3TP92 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctdnep1Q3TP92 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctdnep1Q3TP92 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ctdnep1Q3TP92 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctdnep1Q3TP92 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctdnep1Q3TP92 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctdnep1Q3TP92 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctdnep1Q3TP92 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ctdnep1Q3TP92 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctdnep1Q3TP92 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctdnep1Q3TP92 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctdnep1Q3TP92 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctdnep1Q3TP92 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctdnep1Q3TP92 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Ctdnep1Q3TP92 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Ctdnep1Q3TP92 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ctdnep1Q3TP92 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ctdnep1Q3TP92 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ctdnep1Q3TP92 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ctdnep1Q3TP92 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
Ctdnep1Q3TP92 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Ctdnep1Q3TP92 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ctdnep1Q3TP92 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ctdnep1Q3TP92 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ctdnep1Q3TP92 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ctdnep1Q3TP92 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctdnep1Q3TP92 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ctdnep1Q3TP92 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctdnep1Q3TP92 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ctdnep1Q3TP92 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctdnep1Q3TP92 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctdnep1Q3TP92 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctdnep1Q3TP92 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctdnep1Q3TP92 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctdnep1Q3TP92 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctdnep1Q3TP92 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctdnep1Q3TP92 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctdnep1Q3TP92 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctdnep1Q3TP92 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ctdnep1Q3TP92 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ctdnep1Q3TP92 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ctdnep1Q3TP92 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctdnep1Q3TP92 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ctdnep1Q3TP92 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ctdnep1Q3TP92 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ctdnep1Q3TP92 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctdnep1Q3TP92 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctdnep1Q3TP92 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctdnep1Q3TP92 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ctdnep1Q3TP92 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctdnep1Q3TP92 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ctdnep1Q3TP92 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ctdnep1Q3TP92 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ctdnep1Q3TP92 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms