Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc13Q3TIR1 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc13Q3TIR1 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc13Q3TIR1 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc13Q3TIR1 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc13Q3TIR1 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc13Q3TIR1 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc13Q3TIR1 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc13Q3TIR1 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc13Q3TIR1 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc13Q3TIR1 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc13Q3TIR1 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc13Q3TIR1 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc13Q3TIR1 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc13Q3TIR1 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc13Q3TIR1 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc13Q3TIR1 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc13Q3TIR1 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc13Q3TIR1 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc13Q3TIR1 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc13Q3TIR1 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc13Q3TIR1 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc13Q3TIR1 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc13Q3TIR1 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc13Q3TIR1 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc13Q3TIR1 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc13Q3TIR1 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc13Q3TIR1 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc13Q3TIR1 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc13Q3TIR1 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc13Q3TIR1 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trappc13Q3TIR1 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc13Q3TIR1 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc13Q3TIR1 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc13Q3TIR1 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc13Q3TIR1 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc13Q3TIR1 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc13Q3TIR1 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc13Q3TIR1 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc13Q3TIR1 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc13Q3TIR1 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc13Q3TIR1 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc13Q3TIR1 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc13Q3TIR1 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc13Q3TIR1 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc13Q3TIR1 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc13Q3TIR1 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc13Q3TIR1 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc13Q3TIR1 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc13Q3TIR1 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc13Q3TIR1 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc13Q3TIR1 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc13Q3TIR1 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc13Q3TIR1 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc13Q3TIR1 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc13Q3TIR1 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc13Q3TIR1 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc13Q3TIR1 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc13Q3TIR1 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc13Q3TIR1 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trappc13Q3TIR1 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trappc13Q3TIR1 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trappc13Q3TIR1 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trappc13Q3TIR1 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trappc13Q3TIR1 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trappc13Q3TIR1 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trappc13Q3TIR1 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trappc13Q3TIR1 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trappc13Q3TIR1 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trappc13Q3TIR1 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trappc13Q3TIR1 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trappc13Q3TIR1 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trappc13Q3TIR1 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trappc13Q3TIR1 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trappc13Q3TIR1 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trappc13Q3TIR1 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trappc13Q3TIR1 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Trappc13Q3TIR1 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trappc13Q3TIR1 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trappc13Q3TIR1 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trappc13Q3TIR1 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trappc13Q3TIR1 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trappc13Q3TIR1 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trappc13Q3TIR1 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Trappc13Q3TIR1 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Trappc13Q3TIR1 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trappc13Q3TIR1 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trappc13Q3TIR1 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Trappc13Q3TIR1 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trappc13Q3TIR1 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trappc13Q3TIR1 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trappc13Q3TIR1 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trappc13Q3TIR1 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trappc13Q3TIR1 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trappc13Q3TIR1 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trappc13Q3TIR1 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trappc13Q3TIR1 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trappc13Q3TIR1 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trappc13Q3TIR1 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trappc13Q3TIR1 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms