Protein–RNA interactions for Protein: Q3THK3

Gtf2f1, General transcription factor IIF subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2f1Q3THK3 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2f1Q3THK3 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2f1Q3THK3 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2f1Q3THK3 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2f1Q3THK3 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2f1Q3THK3 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2f1Q3THK3 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2f1Q3THK3 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2f1Q3THK3 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2f1Q3THK3 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2f1Q3THK3 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2f1Q3THK3 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2f1Q3THK3 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2f1Q3THK3 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2f1Q3THK3 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2f1Q3THK3 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2f1Q3THK3 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2f1Q3THK3 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2f1Q3THK3 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2f1Q3THK3 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2f1Q3THK3 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2f1Q3THK3 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2f1Q3THK3 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf2f1Q3THK3 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf2f1Q3THK3 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf2f1Q3THK3 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gtf2f1Q3THK3 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf2f1Q3THK3 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf2f1Q3THK3 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf2f1Q3THK3 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf2f1Q3THK3 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf2f1Q3THK3 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf2f1Q3THK3 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf2f1Q3THK3 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf2f1Q3THK3 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf2f1Q3THK3 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf2f1Q3THK3 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf2f1Q3THK3 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf2f1Q3THK3 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf2f1Q3THK3 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf2f1Q3THK3 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gtf2f1Q3THK3 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf2f1Q3THK3 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf2f1Q3THK3 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf2f1Q3THK3 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf2f1Q3THK3 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf2f1Q3THK3 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf2f1Q3THK3 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf2f1Q3THK3 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf2f1Q3THK3 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf2f1Q3THK3 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf2f1Q3THK3 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf2f1Q3THK3 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf2f1Q3THK3 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gtf2f1Q3THK3 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf2f1Q3THK3 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Gtf2f1Q3THK3 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gtf2f1Q3THK3 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gtf2f1Q3THK3 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gtf2f1Q3THK3 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gtf2f1Q3THK3 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gtf2f1Q3THK3 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gtf2f1Q3THK3 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gtf2f1Q3THK3 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf2f1Q3THK3 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf2f1Q3THK3 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf2f1Q3THK3 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gtf2f1Q3THK3 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gtf2f1Q3THK3 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf2f1Q3THK3 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf2f1Q3THK3 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf2f1Q3THK3 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf2f1Q3THK3 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf2f1Q3THK3 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf2f1Q3THK3 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf2f1Q3THK3 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf2f1Q3THK3 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf2f1Q3THK3 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf2f1Q3THK3 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf2f1Q3THK3 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf2f1Q3THK3 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf2f1Q3THK3 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gtf2f1Q3THK3 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf2f1Q3THK3 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf2f1Q3THK3 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf2f1Q3THK3 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf2f1Q3THK3 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf2f1Q3THK3 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf2f1Q3THK3 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf2f1Q3THK3 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf2f1Q3THK3 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf2f1Q3THK3 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf2f1Q3THK3 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gtf2f1Q3THK3 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf2f1Q3THK3 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf2f1Q3THK3 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf2f1Q3THK3 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf2f1Q3THK3 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf2f1Q3THK3 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf2f1Q3THK3 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms