Protein–RNA interactions for Protein: Q24JP3

Fam178b, Protein FAM178B, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam178bQ24JP3 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
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Fam178bQ24JP3 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Fam178bQ24JP3 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam178bQ24JP3 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam178bQ24JP3 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam178bQ24JP3 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam178bQ24JP3 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam178bQ24JP3 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam178bQ24JP3 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam178bQ24JP3 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam178bQ24JP3 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam178bQ24JP3 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam178bQ24JP3 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
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Fam178bQ24JP3 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam178bQ24JP3 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam178bQ24JP3 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam178bQ24JP3 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam178bQ24JP3 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Fam178bQ24JP3 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam178bQ24JP3 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam178bQ24JP3 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam178bQ24JP3 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam178bQ24JP3 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam178bQ24JP3 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam178bQ24JP3 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam178bQ24JP3 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam178bQ24JP3 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Fam178bQ24JP3 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam178bQ24JP3 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam178bQ24JP3 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam178bQ24JP3 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam178bQ24JP3 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam178bQ24JP3 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam178bQ24JP3 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam178bQ24JP3 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam178bQ24JP3 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam178bQ24JP3 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam178bQ24JP3 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam178bQ24JP3 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam178bQ24JP3 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam178bQ24JP3 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam178bQ24JP3 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam178bQ24JP3 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam178bQ24JP3 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam178bQ24JP3 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam178bQ24JP3 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam178bQ24JP3 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam178bQ24JP3 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam178bQ24JP3 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam178bQ24JP3 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam178bQ24JP3 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam178bQ24JP3 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam178bQ24JP3 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam178bQ24JP3 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam178bQ24JP3 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam178bQ24JP3 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam178bQ24JP3 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam178bQ24JP3 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam178bQ24JP3 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam178bQ24JP3 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam178bQ24JP3 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam178bQ24JP3 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam178bQ24JP3 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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