Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Samd11Q1RNF8 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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