Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Traf3ip1Q149C2 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Traf3ip1Q149C2 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Traf3ip1Q149C2 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Traf3ip1Q149C2 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Traf3ip1Q149C2 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Traf3ip1Q149C2 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Traf3ip1Q149C2 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Traf3ip1Q149C2 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Traf3ip1Q149C2 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Traf3ip1Q149C2 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Traf3ip1Q149C2 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Traf3ip1Q149C2 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Traf3ip1Q149C2 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Traf3ip1Q149C2 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Traf3ip1Q149C2 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Traf3ip1Q149C2 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Traf3ip1Q149C2 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Traf3ip1Q149C2 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Traf3ip1Q149C2 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Traf3ip1Q149C2 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Traf3ip1Q149C2 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Traf3ip1Q149C2 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Traf3ip1Q149C2 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Traf3ip1Q149C2 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Traf3ip1Q149C2 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf3ip1Q149C2 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf3ip1Q149C2 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf3ip1Q149C2 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf3ip1Q149C2 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf3ip1Q149C2 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf3ip1Q149C2 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf3ip1Q149C2 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf3ip1Q149C2 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf3ip1Q149C2 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf3ip1Q149C2 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf3ip1Q149C2 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf3ip1Q149C2 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf3ip1Q149C2 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf3ip1Q149C2 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf3ip1Q149C2 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
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Traf3ip1Q149C2 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf3ip1Q149C2 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Traf3ip1Q149C2 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Traf3ip1Q149C2 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf3ip1Q149C2 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf3ip1Q149C2 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf3ip1Q149C2 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
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Traf3ip1Q149C2 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf3ip1Q149C2 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf3ip1Q149C2 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf3ip1Q149C2 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf3ip1Q149C2 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf3ip1Q149C2 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Traf3ip1Q149C2 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Traf3ip1Q149C2 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Traf3ip1Q149C2 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf3ip1Q149C2 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf3ip1Q149C2 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Traf3ip1Q149C2 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Traf3ip1Q149C2 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf3ip1Q149C2 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf3ip1Q149C2 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf3ip1Q149C2 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Traf3ip1Q149C2 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf3ip1Q149C2 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf3ip1Q149C2 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf3ip1Q149C2 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf3ip1Q149C2 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf3ip1Q149C2 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf3ip1Q149C2 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf3ip1Q149C2 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf3ip1Q149C2 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf3ip1Q149C2 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Traf3ip1Q149C2 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Traf3ip1Q149C2 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Traf3ip1Q149C2 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Traf3ip1Q149C2 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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