Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VgfQ0VGU4 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VgfQ0VGU4 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VgfQ0VGU4 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VgfQ0VGU4 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VgfQ0VGU4 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VgfQ0VGU4 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VgfQ0VGU4 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VgfQ0VGU4 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VgfQ0VGU4 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VgfQ0VGU4 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VgfQ0VGU4 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VgfQ0VGU4 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VgfQ0VGU4 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
VgfQ0VGU4 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VgfQ0VGU4 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
VgfQ0VGU4 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VgfQ0VGU4 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
VgfQ0VGU4 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VgfQ0VGU4 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
VgfQ0VGU4 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VgfQ0VGU4 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VgfQ0VGU4 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VgfQ0VGU4 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VgfQ0VGU4 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VgfQ0VGU4 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VgfQ0VGU4 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VgfQ0VGU4 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VgfQ0VGU4 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VgfQ0VGU4 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VgfQ0VGU4 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VgfQ0VGU4 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VgfQ0VGU4 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
VgfQ0VGU4 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VgfQ0VGU4 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VgfQ0VGU4 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VgfQ0VGU4 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms