Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc162pQ0VG85 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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