Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rundc1Q0VDN7 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms