Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Vps8Q0P5W1 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vps8Q0P5W1 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms