Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Mir181d-201ENSMUST00000102383 72 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 Gm6630-201ENSMUST00000119199 454 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
TrioQ0KL02 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms