Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.6 ms