Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms