Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnn1Q08091 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms