Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Scn8a-201ENSMUST00000082209 11293 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
NrepQ07475 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Styx-205ENSMUST00000226873 12974 ntAPPRIS P1 BASIC8.88□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Pum1-201ENSMUST00000030315 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
NrepQ07475 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
NrepQ07475 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
NrepQ07475 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
NrepQ07475 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Erbb3-201ENSMUST00000082059 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
NrepQ07475 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC8.86□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC8.86□□□□□ -0.99
NrepQ07475 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms