Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms