Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Cntn3Q07409 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Cntn3Q07409 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Cntn3Q07409 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Cntn3Q07409 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Cntn3Q07409 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Cntn3Q07409 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Cntn3Q07409 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Cntn3Q07409 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Cntn3Q07409 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Cntn3Q07409 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Cntn3Q07409 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Cntn3Q07409 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Cntn3Q07409 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms