Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Smim8-205ENSMUST00000108134 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Vmn1r-ps92-201ENSMUST00000120775 517 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 4930486I03Rik-201ENSMUST00000161509 788 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Gm28351-201ENSMUST00000186261 559 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Gm42591-201ENSMUST00000197249 700 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Olfr1449-202ENSMUST00000208624 1296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 4930458B22Rik-201ENSMUST00000209339 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Aoah-202ENSMUST00000221982 919 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 AC132918.1-201ENSMUST00000227877 925 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Gm9575-201ENSMUST00000122140 1339 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Gm44509-201ENSMUST00000205400 1324 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Gm31121-201ENSMUST00000197948 1413 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 4930551O13Rik-201ENSMUST00000145585 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Etfbkmt-207ENSMUST00000147934 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Gm13625-201ENSMUST00000149283 480 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Gm27845-201ENSMUST00000184479 114 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Pantr1-211ENSMUST00000186656 647 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Gm28585-201ENSMUST00000187587 442 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Gm37005-201ENSMUST00000193281 1164 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Gm42710-201ENSMUST00000200608 985 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Gm43596-201ENSMUST00000202818 884 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 AC159886.1-201ENSMUST00000217099 1091 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Vmn1r16-201ENSMUST00000227168 912 ntAPPRIS P2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Siah2Q06986 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms