Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 1700041M19Rik-202ENSMUST00000190908 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccl7Q03366 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms