Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Thbs2Q03350 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Thbs2Q03350 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms